IT 之家 11 月 4 日音信，IT 之家从中国农科院基因组所官方微信公众号获悉，本日《当然・遗传学（Nature Genetics）》在线发表了中国农业科学院深圳农业基因组预计所（岭南当代农业科学与时间广东省本质室深圳分中心）周永锋团队利用东说念主工智能进行葡萄育种的最新预计效果。该预计将大幅责备葡萄育种周期ady狠狠射，且对葡萄农艺性状的展望准确度高达 85%。比拟传统身手，育种效能可栽植 400%。该预计有望完毕葡萄的精确狡计育种，加快葡萄品种立异，并为其他多年生作物育种提供身手参考。

周永锋团队自 2015 年起，便开动聚焦葡萄的狡计育种责任，并于 2023 年发布首个葡萄端粒到端粒齐备参考基因组图谱，干系预计以封面著作发表在《园艺预计（Horticulture Research）》上。

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然则，要完毕精确"狡计"，一个基因组数据远远不够。在此基础上，周永锋团队又不时对包括野生种和栽培品种在内的 9 个二倍体葡萄品种进行测序、拼装，获得 18 个端粒到端粒的单倍型基因组，并整合已有的基因组数据，构建了现在ady狠狠射首个最全面、最准确的葡萄泛基因组（Grapepan v1.0），总长度达 1.43Gb，是单个参考基因组大小的近 3 倍。

为了进一步弄了了葡萄基因与性状之间的关联，周永锋团队从近万份葡萄品种中及第了 400 多份有代表性的葡萄品种，贯穿 3 年对包括果穗大小、浆果中代谢物含量、浆果大小和果皮热枕等在内的 29 个农艺性状进行看望，构建了葡萄基因型图谱和性状图谱。在此基础上，周永锋团队利用数目遗传学分析，轻薄到 148 个与农艺性状显赫干系的位点，其中 122 个位点为初次发现。预计发现，调控不同性状的位点间存在关联性，如可溶性固形物含量和浆果宽度干系位点临近。此外，不同葡萄群体（酿酒、鲜食、好意思洲鲜食杂种）之间存在显赫分化的区域，这些区域中存在与浆果热枕、果皮涩味、浆果方法、果穗分量、果肉硬度、果实大小等干系的多个性状干系的遗传位点，标明对农艺性状歧化遴荐促进了酿酒与鲜食葡萄的分化。

全面、准确的基因组数据是精确"狡计"育种的基础，而若何深远挖掘这些数据来优化育种战略并指令育种？是智能育种必须恢复的问题。周永锋团队决定引入机器学习，通过构建展望模子，凭据评分进行早期个体的展望和遴荐，从而指令、优化育种战略。

在本预计中，预计东说念主员将包含了性状和基因型的数据差异为三个子集：检修集、考据集和测试集。利用机器学习算法领略基因型与性状数据间的复杂集会关系，讹诈检修数据集构建了首个葡萄全基因组遴荐模子，预计进一步通过考据集篡改模子参数，对模子进行优化，临了测试数据集评估最终模子的性能。预计限制标明，都集了结构变异信息和机器学习模子的计较多基因评分展望准确率高达 85%。

通过这一模子，育种家不错快速准确地评估多数育种材料的遗传后劲，从而更好地遴荐优良品种。与杂交育种需要凭据葡萄纯熟后的表型作出判断比拟，全基因组遴荐育种时间在葡萄幼苗时候就不错展望其纯熟后的性状，尽早剔猬缩不相宜条目的幼苗，减少了不消要的东说念主工资本和参加，在葡萄育种应用中有很大的应用后劲，栽植葡萄育种效能，加快葡萄新种质的创制，改进葡萄育种战略。

现在，干系预计效果已央求获批国度发明专利 6 项，已央求外洋专利 1 项。